Rencontre « SARS-CoV 2 et bioinformatique structurale »

SARS-CoV-2 spike glycoprotein
CC0@Wikimedia

Quand : Matinée du 19 Novembre 2020
Où : En ligne (lien communiqué ultérieurement aux inscrits)
Inscription : Gratuite mais obligatoire

Contexte

La pandémie COVID 19 est reliée à un agent pathogène viral, SARS-CoV 2, dont une meilleure compréhension des mécanismes d’infection et réplication, particulièrement à l’échelle moléculaire, permet d’envisager de nouvelles stratégies thérapeutiques et épidémiologiques. Afin de faire face à ce challenge de portée universelle, de nombreuses recherches ont vu le jour depuis le début de l’année 2020 au sein de la communauté scientifique française œuvrant dans le domaine de la bioinformatique structurale.

On pourra par exemple consulter le répertoire de la PDB  listant les ressources sur SARS-Cov-2, ou bien l’exposé donné d’Erik Lindhal sur les protéines du virus.

Objectifs

Cette rencontre, organisée par le GT MASIM du GdR BIM, met l’accent sur les travaux en bioinformatique structurale réalisés autour de SARS-CoV 2. Son programme comprend des résultats, publiés ou en cours de valorisation, basés sur des développements méthodologiques, ou encore ceux inspirés par les challenges spécifiques à l’étude du SARS-CoV 2. Elle permettra de mutualiser les expériences et diffuser les bonnes pratiques, en particulier pour l’accès, l’utilisation, l’analyse et la diffusion des données structurales.

Programme et appel à communications

Le programme complet de la rencontre, comprenant les horaires et résumés des interventions, est disponible ci-dessous, ainsi qu’au format PDF.

8h45 — 8h50 Frédéric Cazals & Yann Ponty
Présentation de l’évènement
8h50 — 9h15 Stéphane Télétchéa (UFIP, Université de Nantes)
COVID-19: past, present and future
9h15 — 9h40 Edoardo Sarti (LCQB, Sorbonne Université)
Statistical analysis of coevolutionary signals on the SARS-CoV-2 Spike protein
9h40 — 10h05 Yasaman Karami et Laura Ortega Varga (Institut Pasteur)
Targeting SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein to fight Covid-19
10h05 — 10h30 Frédéric Cazals (Inria Sophia)
Spikes of SARS-CoV-2: mechanisms and visualization
10:00-10:30 Pause café
11h00 — 11h25 Jean-Philip Piquemal (LCT, Sorbonne Université)
High-Resolution Modeling of SARS-CoV-2 Proteins Structural Dynamics
11h25 — 11h50 Maria Kadukova (Nano-D, Inria Grenoble)
Re-docking of the available MPro co-crystal ligands
11h50 — 12h15 Stephane Redon (OneAngstrom)
SAMSON – Integrated Molecular Design
12h15 — 12h40 Marc Baaden (CNRS IBPC)
FAIR sharing of molecular visualization experiences: COVID-19 use case
12h40 — 13h05 Sebastian Will (LIX, Ecole Polytechnique)
Computational RNA-RNA interaction prediction for elucidating template switching in SARS-CoV-2