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Quand : Matinée du 19 Novembre 2020
Où : En ligne (lien communiqué ultérieurement aux inscrits)
Inscription : Gratuite mais obligatoire
Contexte
La pandémie COVID 19 est reliée à un agent pathogène viral, SARS-CoV 2, dont une meilleure compréhension des mécanismes d’infection et réplication, particulièrement à l’échelle moléculaire, permet d’envisager de nouvelles stratégies thérapeutiques et épidémiologiques. Afin de faire face à ce challenge de portée universelle, de nombreuses recherches ont vu le jour depuis le début de l’année 2020 au sein de la communauté scientifique française œuvrant dans le domaine de la bioinformatique structurale.
On pourra par exemple consulter le répertoire de la PDB listant les ressources sur SARS-Cov-2, ou bien l’exposé donné d’Erik Lindhal sur les protéines du virus.
Objectifs
Cette rencontre, organisée par le GT MASIM du GdR BIM, met l’accent sur les travaux en bioinformatique structurale réalisés autour de SARS-CoV 2. Son programme comprend des résultats, publiés ou en cours de valorisation, basés sur des développements méthodologiques, ou encore ceux inspirés par les challenges spécifiques à l’étude du SARS-CoV 2. Elle permettra de mutualiser les expériences et diffuser les bonnes pratiques, en particulier pour l’accès, l’utilisation, l’analyse et la diffusion des données structurales.
Programme et appel à communications
Le programme complet de la rencontre, comprenant les horaires et résumés des interventions, est disponible ci-dessous, ainsi qu’au format PDF. Les vidéos des exposés sont disponibles sur la chaîne Youtube du GT.
| 8h45 — 8h50 | Frédéric Cazals & Yann Ponty | |
| Présentation de l’évènement | ||
| 8h50 — 9h15 | Stéphane Télétchéa (UFIP, Université de Nantes) | |
| COVID-19: past, present and future | ||
| 9h15 — 9h40 | Edoardo Sarti (LCQB, Sorbonne Université) | |
| Statistical analysis of coevolutionary signals on the SARS-CoV-2 Spike protein | ||
| 9h40 — 10h05 | Yasaman Karami et Laura Ortega Varga (Institut Pasteur) | |
| Targeting SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein to fight Covid-19 | ||
| 10h05 — 10h30 | Frédéric Cazals (Inria Sophia) | |
| Spikes of SARS-CoV-2: mechanisms and visualization | ||
| 10:00-10:30 | Pause café | |
| 11h00 — 11h25 | Jean-Philip Piquemal (LCT, Sorbonne Université) | |
| High-Resolution Modeling of SARS-CoV-2 Proteins Structural Dynamics | ||
| 11h25 — 11h50 | Maria Kadukova (Nano-D, Inria Grenoble) | |
| Re-docking of the available MPro co-crystal ligands | ||
| 11h50 — 12h15 | Stephane Redon (OneAngstrom) | |
| SAMSON – Integrated Molecular Design | ||
| 12h15 — 12h40 | Marc Baaden (CNRS IBPC) | |
| FAIR sharing of molecular visualization experiences: COVID-19 use case | ||
| 12h40 — 13h05 | Sebastian Will (LIX, Ecole Polytechnique) | |
| Computational RNA-RNA interaction prediction for elucidating template switching in SARS-CoV-2 | ||